Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL23P62829 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL23P62829 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL23P62829 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL23P62829 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms