Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOBP62745 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHOBP62745 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOBP62745 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOBP62745 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOBP62745 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOBP62745 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms