Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VBP1P61758 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VBP1P61758 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VBP1P61758 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VBP1P61758 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VBP1P61758 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms