Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms