Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms