Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRLP54845 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRLP54845 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRLP54845 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRLP54845 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRLP54845 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRLP54845 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRLP54845 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRLP54845 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRLP54845 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRLP54845 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRLP54845 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRLP54845 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRLP54845 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRLP54845 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms