Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRAP54198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRAP54198 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRAP54198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIRAP54198 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRAP54198 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRAP54198 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRAP54198 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRAP54198 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRAP54198 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRAP54198 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRAP54198 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRAP54198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRAP54198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRAP54198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms