Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 YNL033WYNL033W 855 nt5.09□□□□□ -1.59
SNF12P53628 CKB2YOR039W 777 nt5.09□□□□□ -1.59
SNF12P53628 MPD1YOR288C 957 nt5.09□□□□□ -1.59
SNF12P53628 ECM8YBR076W 1065 nt5.09□□□□□ -1.59
SNF12P53628 YBR292CYBR292C 372 nt5.09□□□□□ -1.59
SNF12P53628 IXR1YKL032C 1794 nt5.09□□□□□ -1.6
SNF12P53628 RFT1YBL020W 1725 nt5.09□□□□□ -1.6
SNF12P53628 BIT2YBR270C 1638 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PDI1YCL043C 1569 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PHO92YDR374C 921 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YDR445CYDR445C 408 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 GRX4YER174C 735 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 TIM21YGR033C 720 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PGA3YML125C 939 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YBL077WYBL077W 432 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YOR342CYOR342C 960 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 NRG2YBR066C 663 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ECM33YBR078W 1290 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SEC39YLR440C 2130 nt5.08□□□□□ -1.6
SNF12P53628 NOT3YIL038C 2511 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ELP2YGR200C 2367 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SMP1YBR182C 1359 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 BRF1YGR246C 1791 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PEX19YDL065C 1029 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 BUD30YDL151C 582 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 DOS2YDR068W 933 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YDR290WYDR290W 330 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ERG25YGR060W 930 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 VMA16YHR026W 642 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YJR085CYJR085C 318 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YKR047WYKR047W 306 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 NIT3YLR351C 876 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YLR374CYLR374C 390 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YNL217WYNL217W 981 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PPG1YNR032W 1107 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 STE50YCL032W 1041 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 DED81YHR019C 1665 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 FOL1YNL256W 2475 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 IFM1YOL023W 2031 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SHM1YBR263W 1473 nt5.07□□□□□ -1.6
SNF12P53628 Q0255Q0255 1419 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 MTF2YDL044C 1323 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YDL183CYDL183C 963 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 GIC2YDR309C 1152 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 CAD1YDR423C 1230 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 BGL2YGR282C 942 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 NTR2YKR022C 969 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PCD1YLR151C 1023 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ROT1YMR200W 771 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YCL041CYCL041C 495 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SYG1YIL047C 2709 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SLT2YHR030C 1455 nt5.06□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PMT5YDL093W 2232 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 UBA2YDR390C 1911 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PSE1YMR308C 3270 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YCR100CYCR100C 951 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 UBC5YDR059C 447 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ACT1YFL039C 1128 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PAN6YIL145C 930 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 snR3snR3 194 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 IBA57YJR122W 1494 nt5.05□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YHR177WYHR177W 1362 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 NUP42YDR192C 1293 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PAD1YDR538W 729 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 COG7YGL005C 840 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 EGD2YHR193C 525 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YIL152WYIL152W 708 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 POL32YJR043C 1053 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YAL066WYAL066W 309 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 RAD10YML095C 633 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 HEK2YBL032W 1146 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YOR200WYOR200W 399 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 BBP1YPL255W 1158 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 TIF5YPR041W 1218 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 UBC4YBR082C 447 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 DAL81YIR023W 2913 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 APM2YHL019C 1818 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SIR1YKR101W 1965 nt5.04□□□□□ -1.6
SNF12P53628 QDR1YIL120W 1692 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 ALB1YJL122W 528 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SFH5YJL145W 885 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 PRM9YAR031W 897 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 CPR8YNR028W 927 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 TAF3YPL011C 1062 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 SEC9YGR009C 1956 nt5.03□□□□□ -1.6
SNF12P53628 YBR139WYBR139W 1527 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 UBP9YER098W 2265 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 YMR1YJR110W 2067 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 YDR154CYDR154C 351 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 YEA4YEL004W 1029 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.02□□□□□ -1.61
SNF12P53628 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.02□□□□□ -1.61
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