Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
SMARCA4P51532 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SMARCA4P51532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms