Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA2P51531 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA2P51531 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms