Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK7P50613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK7P50613 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK7P50613 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK7P50613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK7P50613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK7P50613 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK7P50613 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK7P50613 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK7P50613 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK7P50613 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK7P50613 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK7P50613 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK7P50613 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK7P50613 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK7P50613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK7P50613 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK7P50613 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK7P50613 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK7P50613 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK7P50613 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK7P50613 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK7P50613 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK7P50613 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK7P50613 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms