Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV1P50549 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV1P50549 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV1P50549 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV1P50549 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV1P50549 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ETV1P50549 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV1P50549 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV1P50549 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV1P50549 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms