Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATMP50440 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATMP50440 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATMP50440 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GATMP50440 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATMP50440 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATMP50440 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GATMP50440 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GATMP50440 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATMP50440 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GATMP50440 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GATMP50440 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATMP50440 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATMP50440 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATMP50440 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATMP50440 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GATMP50440 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GATMP50440 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms