Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK2P49760 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK2P49760 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK2P49760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLK2P49760 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK2P49760 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK2P49760 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK2P49760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK2P49760 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLK2P49760 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLK2P49760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLK2P49760 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK2P49760 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK2P49760 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK2P49760 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK2P49760 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK2P49760 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK2P49760 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK2P49760 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK2P49760 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK2P49760 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK2P49760 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK2P49760 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK2P49760 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms