Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms