Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNTBP49356 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNTBP49356 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNTBP49356 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNTBP49356 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTBP49356 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTBP49356 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNTBP49356 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNTBP49356 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTBP49356 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTBP49356 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTBP49356 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTBP49356 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms