Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT6CP48668 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms