Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCN1P48444 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms