Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSKP43235 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSKP43235 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSKP43235 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSKP43235 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSKP43235 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSKP43235 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSKP43235 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSKP43235 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSKP43235 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms