Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPOP42166 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPOP42166 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMPOP42166 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMPOP42166 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMPOP42166 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMPOP42166 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMPOP42166 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMPOP42166 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPOP42166 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMPOP42166 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMPOP42166 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMPOP42166 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMPOP42166 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMPOP42166 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMPOP42166 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMPOP42166 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMPOP42166 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMPOP42166 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMPOP42166 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMPOP42166 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMPOP42166 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMPOP42166 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPOP42166 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPOP42166 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMPOP42166 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMPOP42166 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms