Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP12P39900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP12P39900 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP12P39900 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP12P39900 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms