Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBRP36941 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBRP36941 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBRP36941 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBRP36941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBRP36941 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBRP36941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBRP36941 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBRP36941 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBRP36941 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms