Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 YDL183CYDL183C 963 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 ERV29YGR284C 933 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 PFS1YHR185C 714 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 PGU1YJR153W 1086 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 CCS1YMR038C 750 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YMR144WYMR144W 1029 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MUM2YBR057C 1101 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RPO26YPR187W 468 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SKI2YLR398C 3864 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 HIS7YBR248C 1659 nt7.38□□□□□ -1.23
CSE4P36012 GPA1YHR005C 1419 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RAD57YDR004W 1383 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 HMS1YOR032C 1305 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RPB7YDR404C 516 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 GAS2YLR343W 1668 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YML082WYML082W 1950 nt7.37□□□□□ -1.23
CSE4P36012 TIM54YJL054W 1437 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 NHP10YDL002C 612 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YGR111WYGR111W 1203 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MRPS35YGR165W 1038 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RSM27YGR215W 333 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 GRE3YHR104W 984 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 ICT1YLR099C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MRPL16YBL038W 699 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 DUG3YNL191W 1074 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RAD3YER171W 2337 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 DBP9YLR276C 1785 nt7.36□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RTT106YNL206C 1368 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 UTP7YER082C 1665 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 CWC23YGL128C 852 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 PRP38YGR075C 729 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 COS8YHL048W 1146 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YJU3YKL094W 942 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YMR084WYMR084W 789 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 KNS1YLL019C 2214 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 RPT1YKL145W 1404 nt7.35□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MPA43YNL249C 1629 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MNN5YJL186W 1761 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YDR008CYDR008C 351 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YGR182CYGR182C 354 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 CIA2YHR122W 696 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 GSP1YLR293C 660 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YLR339CYLR339C 552 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 MDJ2YNL328C 441 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YPL062WYPL062W 405 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 DIM1YPL266W 957 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YPR147CYPR147C 915 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 PKC1YBL105C 3456 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 NUD1YOR373W 2556 nt7.34□□□□□ -1.23
CSE4P36012 ART10YLR392C 1557 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 HTD2YHR067W 843 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 CIS3YJL158C 684 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 PRP21YJL203W 843 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 SFC1YJR095W 969 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 ADD37YMR184W 597 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 RPL3YOR063W 1164 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 PWR1PWR1 941 nt7.33□□□□□ -1.24
CSE4P36012 IMA5YJL216C 1746 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 SPS2YDR522C 1509 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 NRG1YDR043C 696 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 COX26YDR119W-A 201 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YER010CYER010C 705 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 COBQ0105 1158 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 RME1YGR044C 903 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 DOG2YHR043C 741 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 DOG1YHR044C 741 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 RFC2YJR068W 1062 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YKL151CYKL151C 1014 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 GPM3YOL056W 912 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YOL163WYOL163W 510 nt7.32□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YER186CYER186C 921 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 FIP1YJR093C 984 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 APN1YKL114C 1104 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 COS9YKL219W 1224 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 TFS1YLR178C 660 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YAR069CYAR069C 294 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 SPS19YNL202W 879 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YBL094CYBL094C 333 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 YPR123CYPR123C 435 nt7.31□□□□□ -1.24
CSE4P36012 AVT4YNL101W 2142 nt7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms