Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms