Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDXP35241 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDXP35241 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDXP35241 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RDXP35241 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDXP35241 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDXP35241 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDXP35241 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDXP35241 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms