Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHRP34981 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHRP34981 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHRP34981 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHRP34981 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHRP34981 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHRP34981 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHRP34981 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHRP34981 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms