Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms