Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RYKP34925 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RYKP34925 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RYKP34925 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RYKP34925 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RYKP34925 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RYKP34925 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RYKP34925 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms