Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP1P32455 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP1P32455 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP1P32455 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP1P32455 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP1P32455 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP1P32455 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP1P32455 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP1P32455 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms