Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPS1P31327 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPS1P31327 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CPS1P31327 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CPS1P31327 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPS1P31327 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPS1P31327 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPS1P31327 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPS1P31327 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CPS1P31327 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPS1P31327 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CPS1P31327 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPS1P31327 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPS1P31327 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CPS1P31327 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CPS1P31327 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CPS1P31327 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPS1P31327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPS1P31327 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPS1P31327 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPS1P31327 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms