Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA5P30532 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA5P30532 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms