Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTKP29376 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTKP29376 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTKP29376 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTKP29376 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LTKP29376 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LTKP29376 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LTKP29376 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTKP29376 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTKP29376 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTKP29376 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTKP29376 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTKP29376 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTKP29376 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTKP29376 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTKP29376 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTKP29376 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTKP29376 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTKP29376 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTKP29376 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTKP29376 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LTKP29376 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTKP29376 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTKP29376 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTKP29376 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTKP29376 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTKP29376 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms