Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms