Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2AP24928 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms