Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRGP23470 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRGP23470 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRGP23470 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms