Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms