Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCLP19338 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCLP19338 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCLP19338 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCLP19338 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCLP19338 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCLP19338 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCLP19338 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCLP19338 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCLP19338 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCLP19338 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCLP19338 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCLP19338 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCLP19338 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCLP19338 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCLP19338 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms