Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC1P18887 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms