Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GM2AP17900 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GM2AP17900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GM2AP17900 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GM2AP17900 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GM2AP17900 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GM2AP17900 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GM2AP17900 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms