Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms