Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB8P17481 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms