Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB3P16520 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB3P16520 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB3P16520 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB3P16520 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms