Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRAP16234 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRAP16234 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms