Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DOBP13765 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DOBP13765 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms