Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYGBP11216 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYGBP11216 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYGBP11216 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYGBP11216 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms