Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD3P0DMS9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms