Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS56P0CW18 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRSS56P0CW18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS56P0CW18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.2 ms