Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms