Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP2P08253 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP2P08253 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP2P08253 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP2P08253 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP2P08253 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP2P08253 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP2P08253 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP2P08253 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP2P08253 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP2P08253 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP2P08253 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP2P08253 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms