Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI1P08151 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI1P08151 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI1P08151 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI1P08151 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI1P08151 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI1P08151 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI1P08151 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms