Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CENPBP07199 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPBP07199 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CENPBP07199 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CENPBP07199 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CENPBP07199 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CENPBP07199 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CENPBP07199 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CENPBP07199 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CENPBP07199 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CENPBP07199 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CENPBP07199 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CENPBP07199 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms